I would rather pick a tasty one even if it is unhealthy than the one that is healthy but not tasty.
would rather ~ than~:〜よりは〜を選ぶ、〜よりは〜がいい
(現実には起こっていないシチュエーションを想定しているのでwould を使います)
pick:選ぶ
unhealthy:健康的でない=体に悪い
even if 〜:たとえ〜でも
訳)たとえ体に悪くても、体にいいけどマズイものよりは美味しいものを選びます。
また、"one" は『それ』という意味になりますが、その個体を限定しない場合(同じ種類のものを指す場合)に使います。"it" を使ってしまうと、そのものが目の前にあって、種類全体を指すのではなく、その特定の個体を指すことになってしまうからです。