回答
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Company A holds a 30% stake in our company.
「〜の株を取得している/保有している」は、hold a stake in 〜 とも言います。
stakeは「利害関係」から「出資金」という意味もあり、stakeholderは企業の利害関係者、つまり株主のことを言います。
もちろん、Yumikaさんの own/hold stakes はとてもポピュラーな表現です。
回答
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Company A owns 30% of our company's shares.
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Company A holds 30% shares in our company.
株の保有については"own" または"hold"という動詞を使います。