There are no accommodations that have a capacity for four hundred students in Shiga Prefecture..
"there are 〜" は「複数の物・人が存在する」という表現です。複数形にしているのは、「数ある施設の中で」一軒もない、となる為です。
"accommodation" は「宿泊施設、収容設備」を表します。
"have a capacity of 〜" は「(主語には)〜人収容できる」ということを表現します。
「県」は "prefecture" と表します。