私の被害妄想かもしれないけどって英語でなんて言うの？

Paranoidは名詞の形もありますが、ほとんど形容詞として使われるようです。

ですので「My Paranoid」という使い方よりは、「I am paranoid」とか「I get paranoid」という使い方をします。

ですので、私の勘違いかもしれないけど...と言いたい時は
It may be just that I am too paranoid
I may be too paranoid,
I may be just too paranoid,
というように言えます。

「~な気がする」は投稿者様のようにThinkも使えますし、Feel (〜と感じる)とか Have a feeling (~のような気がする)という言い方もできます。

「私の被害妄想かもしれないけど、上司に嫌われている気がする」という表現には、以下のようなフレーズが適しています。

• "It might just be my paranoia, but I think my boss doesn't like me."
  ここでの "It might just be my ..." の形式は、自己の見解や感觉を示す表現としてよく用いられます。"might" を使って推測の可能性を表し、被害妄想の可能性を示します。

• "I might be just being paranoid, but I think my boss doesn't like me."
  上記のフレーズと同様に、自分の感情または信念について不確定性を表現する方法ですが、ここでは "I am being ..." の形式を用いて自分自身の状態を強調しています。