1) Did I misunderstand (your question)?
「(あなたの質問を)勘違いしましたか?」
misunderstand で「誤解する・勘違いする」
2) Did I not understand that correctly?
「正しく理解しませんでしたか?」
correctly で「正確に・正しく」
ご参考になれば幸いです!
Did I answer your question?
Is that answer your question?
先生からの質問などで、答えながらちょっと勘違いしてるかな?と不安になったり、した時に、上記のような言いまわしも可能ですよ。
あなたの質問に答えましたか?
もしくはあなたの質問の答えですか? と言った表現です。
参考になさってくださいね。