I don't know if my headache and smoking are connected or not.
「私の頭痛」は my headache で、「喫煙」は smoking と言います。
「〜の関係があるかわかりません」は "I don't know if X and Y are connected or not" という文型です。
if ~ or not は 「Aするかどうか〜Bする」というパータンです。
I'm not sure whether my headaches and my smoking habit are actually related.
こんにちは！
ご質問ありがとうございます。
ご質問について、いくつか言い方が考えられますが、例えば、
I'm not sure whether my headaches and my smoking habit are actually related.
とすると、「頭痛と喫煙に[関連がある](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/91158/)かどうか分かりません。」となります。
役に立ちそうな単語とフレーズ
be related 関連がある
connected つながっている
I'm not sure whether ... 〜かどうか分かりません
参考になれば幸いです。
アメリカ合衆国 
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