I think there's something you're not telling me as well.
どちらも「君だって僕に隠していることがある。」という言い方です。
1) I think you're keeping something from me too.
keep something from 人 で「人に秘密にする・隠す」という言い方です。
2) I think there's something you're not telling me as well.
something you're not telling me で「あなたは私に言ってないことがある」となり「あなたは隠していることがある」と言えます。
ご参考になれば幸いです!