It costs more than I thought. は、「思ったより[高いわね](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/51864/)。」
It's a little higher than I like. は、「ちょっと高めね。私好みの[値段](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/36967/)じゃないわ。」みたいな意味。
It's a little more than more than I can afford right now. は、「ちょっと高すぎて手が出ないわ。」高くて買えないというような意味があります。
こんにちは。
様々な言い方ができると思いますが、例えば次のような英語表現はいかがでしょうか:
It's a little expensive.
少し高いですね。
It's more than I thought.
思っていたよりも高いですね。
more than I thought は「思っていたよりも高い」という意味の英語表現です。
ぜひ参考にしてください。