That's not clean. Use the different one.
それはきれいじゃないよ。違うものを使って。
That one is dirty. Use another one.
それは汚いよ。もう一枚別のを使って。
よくよく思い返すと、あまりtissueと言わない気がします。製品名としてはfacial tissueなどで売っているのですが。Kleenex(メーカー名ですが)と言ったり、そもそも paper towel や napkin の方が身近にある印象です。tissueというと体の組織などの方が先にイメージされる気がします(個人差があるかもしれません)