大事な悩みだけど大したことないって英語でなんて言うの？

"It is serious"＝「大変なことではある」 "but I know you will be able to handle it well"＝「でもあなたら、上手くそれに対応できることを私は分かっている」 あるいは、「乗り越える」という場合でしたら、"It is serious, but I know you will be able to overcome it."と言えます。 ご参考になると良いです！