to intentionally hide a malicious program (in something)
to intentionally hide malware (in something)
悪意あるプログラム とは英語で "a malicious program" (複数:"malicious programs") になります。ウイルス以外にもたくさんの種類がありますが一般に "malware" (malicious + software)と呼ばれています。
意図的に とは英語で "intentionally" と言います。
(何かを)忍び込ませる とは "to sneak (something) in", "to sneak in (something)" と言えます。
to intentionally sneak in a malicious program
意図的に悪意あるプログラムを忍び込ませる
to intentionally sneak in malware
意図的にマルウェアを偲びこませる
英語では "to intentionally hide malware in (something)" 「意図的に(何かに)マルウェアを隠す」とよく使われています。
He intentionally hid malware in that program.
彼は意図的にあのプログラムにマルウェアを隠した。
He intentionally hid malware in the game he made.
彼は意図的に彼の作ったゲームにマルウェアを隠した。