I don't know how to do it, but I will do my best to figure it out as I go.
こんにちは!
ご質問ありがとうございます。
ご質問について、いくつか言い方が考えられますが、例えば、
I don't know how to do it, so I will wing it.
とすると、『やり方がわからないから[自分なりにやってみる。](https://eikaiwa.dmm.com/uknow/questions/6282/)』と言えます。
少し変えて
I don't know how to do it, but I will do my best to figure it out as I go.
とすると、『私はそれをどうやってやるのか知らないが、できる限りでやりながら何とかする。』となり、ご質問にあるようなニュアンスで伝えられます。
役に立ちそうな単語とフレーズ
wing it 即興でやる
figure out 解き明かす、解明する、理解する、把握する
参考になれば幸いです。