I think we should just be friends because things won't work out when we are apart in different countries.
「別れましょう」の言い方はいろいろありますが、
"we should just be friends"と言えば「単に友達でいよう」という感じで少し柔らかいニュアンスで伝わるかなと思います。
単に「別れよう」ならば"Let's break up."とはっきり言うこともできます。
"things won't work out"で「物事がうまく行かなくなる」つまり遠距離恋愛は無理（難しい）ということを伝えることができます。
It's hard to be in a long distance relationship when you don't live in the same country.
I don't know how we will make this long distance relationship work since we live in different countries.
I don't think we can make a long distance relationship work since we live in different countries.
1) 「遠距離恋愛は難しい」は、"It's hard to be in a long distance relationship" です。
2) 交際を上手く続けられるかわからないといった意味の「難しさ」を伝えたい場合は、
make it work （うまくやり遂げる）を応用して
"I don't know how we will make this long distance relationship work"、
3) 遠距離は上手くいかないという思いがある場合は、
"I don't think we can make a long distance relationship work"と言うこともできます。
「国が違う上に」は、
when you don't live in the same country (同じ国に住んでいない）
since we live in different countries（違う国に住んでいる・いる）
と表現できます 。
日本 
