You get charged a fee every time you make a withdrawal, so it’s better to withdraw it all at once
It’s better to make as few withdrawals as possible
まとめて引き落とす=to withdraw it all at once, to withdraw everything at once
at onceは、訳語通りに「同時に」になりますが、この場合は「まとめて〜一度で〜」という感じです。また、「出来るだけ一度で」は as few times as possibleになります。
手数料がかかる=To be charged a fee, この場合、 you get charged a fee
ご参考になれば幸いです。
アメリカ合衆国 
